药学专业课程设置包括通识教育，专业教育和实践教育三部分，其中专业核心课程包括药物化学、药剂学、药理学、药物分析学、药事管理学、生药学、天然药物化学等。
制药工程专业课程设置包括通识教育，专业教育和实践教育三部分，其中专业核心课程包括简明药物化学、药物分析、化学制药工艺学、制药设备与车间设计、制药过程安全与环保、药品生产质量管理、工业药剂学等。
生物制药专业课程设置包括通识教育，专业教育和实践教育三部分，其中专业核心课程包括生物制药工艺学、发酵工程、生物制药设备、药剂学、药理学、药物分析、药事管理等。